二代将军德川秀忠有三子，其中二子德川忠长已经死了几年，而且膝下无子，众人只好将其三子保科正之请了回来。
保科正之是德川秀忠的第三个儿子，后来被过继给保科正光当了养子，成为信浓国高远藩的藩主领三万石俸禄，德川家光对这个弟弟很看重，几年前让其到出羽国山形藩领二十万石俸禄，可惜好景不长随着南部家的崛起，他被赶了出来，只能逃回江户城隐居。
此时这个德川秀忠唯一的直系后人被找出来，才算解了无将军的危局。保科正之因为被赶出来而穷困潦倒，虽然有哥哥的接济也过得颇为清苦，如今突然被邀请担任将军之位，他自然很高兴就接受了。
当安云和酒井晴美登陆日本的时候，保科正之刚刚恢复了自己的本名德川幸松，成为了江户幕府第四代将军，然而他的位子还没做热，华军已经展开了行动。
华军本来就有一部分军队占据着伊亚，监视着日本各地的局势，这里不但住有三千华军士兵，还有酒井观三建立的维持会以及华军一手训练的十万日本皇协军可用。
当华军第一海军陆战军和血狼团登陆之后，兵力充足的华军立刻向江户幕府发起了进攻。当初江户幕府始终没有向大明低头，等于是双方保持着战争状态，就算华军不宣而战也不算违反规矩，结果江户的军队一触即溃，很快就被消灭了。德川幸松等高层被杀，连同伊贺忍者也被连根拔起，服部半藏等人被乱枪打成了筛子。
利用日本皇协军掌控各地方，因为都是日本人，他们能够很好的融入当地，将各地百姓的反抗情绪降到最低，而华军主力则一路高歌猛进，已经担任军长的谷正明率领手下三个师兵分三路，直接攻向了南部家掌控的地盘。
南部家虽然有些实力，对上精锐的华军却很难打出什么漂亮仗来。在日本国内任何一方只要能拿出上万支火绳枪，已经是几乎无敌的存在了，他们哪里见过数百门火炮同时发射开花弹的声势，士兵毫无防炮的经验，直挺挺的挨炸造成重大伤亡。
战斗仅仅进行了一个多月，南部家即告投降，华军却没有让他们好过，与德川幕府地区被占领一样，南部重信以下的所有武士阶层都遭到屠戮，所有被抓获的日本人除了老弱被清理之外，青壮全部变成了奴隶。
调转枪口的华军将矛头指向前田家，伴随着血狼团的前期破坏，前田家同样没有多少抵抗能力，很快遭到了吞并，同样的清洗也在此进行。经过三个多月的鏖战，华军已经占领了除天草四郎控制区之外的全部本州岛，而接下来的作战就没有那么容易了。
天照十字军是被宗教武装了思想的，这样的军队战斗意志最是强烈，根本就不会感受到死亡威胁，哪怕打到最后一个人也会继续冲锋。双方进行了几次小冲突之后，华军就感受到了对方的这种魔性，而天草四郎也终于知道自己的军队不是华军的对手，所以双方都保持了克制。
安云和酒井晴美感觉这样打下去损伤太大，华军也可能出现较大的伤亡，更何况天草四郎也发来的亲笔信，希望能够与大明和平共处，所以军事行动暂时停了下来，朱聿键手中的那份文件，就是上报的情况以及天草四郎的亲笔信。