夜晚，博物馆爆炸的声音突然响起，惊醒了小智，皮卡丘以及小刚，两人迅速的起床往博物馆跑去。
博物馆研究室内
烟雾弥漫着一道影子快速的的穿梭在烟雾中，在得知宝可梦已经完全复原之后，小智与小刚也松了口气，小智追着那只宝可梦先行跑去，小刚则是跟在后面。
不知不觉间两人跟着跑到了博物馆的另一面，化石翼龙这时正停在树枝上，还未等小智派出皮卡丘，超梦已经使用念力将化石翼龙控制住了，并将化石翼龙从树上移到了小智面前，随后超梦看向小智，小智心领神会走上前，将手放在化石翼龙的头上，似乎是察觉到了小智的安抚，化石翼龙也安静了下来。
“从化石中苏醒，发现自己身处在一个陌生的地方，周围熟悉的一切都不见踪迹，所以很害怕吧。”小智安抚着询问。
“化龙！”化石翼龙回答着，语调中是不安，见此，小智伸手抱住化石翼龙的脑袋贴了上去。
那一刻化石翼龙似乎察觉到了小智的心情也安静了下来。
“那么，以后和我一起面对这个世界吧，虽然和你的世界不一样，但也是一个很美好的世界喔！”小智笑着看向化石翼龙。
最终化石翼龙点了点了头，一旁的皮卡丘见状也是跳上了小智肩膀，凑过去贴了贴化石翼龙，最后，超梦收了念力，化石翼龙也主动进入了小智的精灵球。
事情落幕，小刚也走上前伸手拉起小智，道：“恭喜你，小智！那么明天由我来给化石翼龙做份特制的宝可梦食物吧！”
“谢谢你，小刚！”小智也是感激着看向小刚，随后两人与皮卡丘回到了宝可梦中心，趁着天热还未亮开始补觉。
第二天，小智与小刚准时的起来，洗漱过后先在宝可梦中心用了早餐，便一同前往博物馆，因为他们今天要去再去博物馆看看其他的化石宝可梦。而小智也要完成这次到博物馆的任务。
从最大的盾甲龙室出来，时间也到了中午，于是小智与小刚再次来到了昨天中午的那个公园，将所有宝可梦放出来后，小智也和化石翼龙介绍着利欧路，耿鬼，快龙，大葱鸭还有超梦。
化石翼龙再次见到超梦，可见的有些慌张，小智见到慌张的化石翼龙，再次耐心的安抚着，在得知超梦不会伤害自己后化石翼龙明显的松了口气，随着小刚做好午餐，小智也是先给宝可梦们分完宝可梦食物，便和超梦，小刚一起开始用餐。
“欸？梦幻呢？小智。”小刚看了看还未出现的梦幻疑惑的问道。
“梦幻祂可能又跑其他地方去玩了吧，如果要回来的会回来，不回来的话也没问题的。”小智解释道，原因无他经过这几天的相处小智也从之前的担心，疑惑，变成了现在的无奈。
用完餐后，小刚将早就准备好的宝可梦食物递给小智，因为小刚打算继续去学习了，小智也鼓励着他，接过小刚递过来的宝可梦食物，放进背包。
小刚在见到小智收好宝可梦食物后，耐心的嘱咐着，并表示等到小智决赛，他也会给小智加油后，便挥手离开了。
小智目送着小刚离开，也收回了宝可梦，带着皮卡丘，超梦一起往枯叶市回去。
途中的风景小智也遇到了回来的梦幻，拿出小刚给梦幻特别制作的食物，递给梦幻，梦幻瞅了一眼，拿了一颗开始吃，其余的则示意小智先收起来，小智也是照做，梦幻吃完后则是重新不知道跑哪去玩儿了。
而回到枯叶市樱木研究所的小智则是想起了聊天群，随后打开聊天群
【小智：大家好啊】
【凤王：小智，难为你还记着有这个聊天群了】
【洛奇亚：没错】
【骑拉帝纳：我赞同】
【帝牙卢卡，帕路奇犽：复议】
【拉帝亚斯：没错】
【拉帝欧斯：嗯】
【裂空座：复议】
【盖欧卡，固拉多：+1】
【小智：不好意思，让大家惦记了】
【凤王：好了，其实也没事，毕竟小智你是在为梦想努力】
【洛奇亚：是的，不过偶尔也要和我们联系联系，以前是没办法，现在毕竟有这个交流平台】
【小智：好的？我会的】
【谢米：对了，小智，咪过段时间去找你】
【拉帝亚斯：还有我和哥哥】
【小智：好的，我很欢迎大家哦】
不知不觉间，已经到了晚餐时间，小智便和大家打过招呼后便关闭了聊天界面，此时，群里仍旧热闹着。
【裂空座：不如我和你们说说当初在卡洛斯和小智一起联手对战某六只神兽吧】
【凤王：这个我也知道，毕竟全程围观着】
【骑拉帝纳：！】
【盖欧卡：！】
【固拉多：！】
【帝牙卢卡：！】
【帕路奇犽：！】
【骑拉帝纳：我建议不如问问固拉多祂到家没？】
【帝牙卢卡，帕路奇犽：这个可以有】
【盖欧卡：哈哈】
【固拉多：谢邀，已经到家了】
【胡帕：是胡帕送回去的哦】
【凤王：哈哈】
【洛奇亚：我一般不笑，除非忍不住，哈哈.jpg】
【裂空座：我也是，忍俊不禁.jpg】
【盖欧卡：我笑得很大声】
【骑拉帝纳：我也是，除非忍不住，忍俊不禁.jpg】
【帕路奇犽，帝牙卢卡：真的笑死我了】
【胡帕：嘻嘻.jpg】
【捷克罗姆，雷希拉姆：想听全过程】
【达克莱伊，谢米：复议】
【玛夏多：想看全过程】
【未知图腾：复议】
【无极汰那：zzz~】
【苍响，藏玛然特：竖起耳朵.jpg】
【阿尔宙斯：。】
【凤王：手动闭嘴.jpg】
【洛奇亚：手动沉默.jpg】
【裂空座：zzz~】
【盖欧卡，固拉多：zzz~】
【骑拉帝纳：手动闭嘴.jpg】
【帝牙卢卡，帕路奇犽：安静.jpg】
见到阿尔宙斯出来，众神兽似乎察觉到了什么，纷纷安静下来，不在讨论那次荒漠市发生的事，又是平常安静的一夜