第二日清晨
在花子的催促下，小智和皮卡丘利落的收拾好之后，便一同出了门，向着大木研究所而去，此时大木博士已经在门口等着了。
“大木博士，你找我？”见到大木博士，小智疑惑的询问。
“实际上是因为我晚辈在枯叶市成立了新研究所，所以想邀请你参加，小智你应该会去吧！”大木博士解释道。
“当然去！我和皮卡丘一起去。”小智双眼微亮道。
“当然！”皮卡丘还未回答便听见花子的声音，小智回头：“妈妈？”
“来给你送便当，没想到听到了好消息。”花子也是开心道：“那我们出发吧！”
枯叶市
到达枯叶市，大木博士先去停车，而花子则带着吸盘魔偶前往市内，小智和皮卡丘则是先行前往樱木研究所，还未踏进研究所小智似有所感的回头，随后便和皮卡丘向着一侧的树林跑去。
只见超梦在那似乎等着他，此刻，小智才想起打开面前收起的光幕，果然，超梦说来寻他。
“超梦？！”“皮卡？！”小智和皮卡丘异口同声的喊道。
“许久不见，小智，皮卡丘。”超梦心灵感应道。“我思考了许久，自独自踏上旅程也过了很久，旅途中绝大多数的经历也不过只是昔日掠影般的存在，胸腔之内的那颗心脏并不能为之跳动。冒充人类在城市里活动，或是像野生宝可梦一样在野外生活，都可以做到，却又都不能融入其中。
我不该在那里。每一次改换地点在城市或是在野外生活一段时间，都会隐约有这样的感觉。我不该在这里。
我又该去往什么地方？
自一开始就在追寻的那个问题的答案也未能成功得到，一次次在心底反问自己，一次次地都只能得到一片虚无作为回答。
我到现在依然不知道自己是什么。为什么是存在于这里。也就是在昨晚有人告诉我说，如果实在不知道该如何，便来找你，祂说同你一起旅行或许我能找到答案，所以，我便来找你了。”
听着超梦的话，小智与皮卡丘对视一眼：“那我们一起旅行吧？”
见着小智与皮卡丘热情的邀请，超梦沉默片刻点头同意了。
“小智，再不快点，开幕仪式就要晚了。”身后传来大木博士的声音。
“这就来了，大木博士。”小智回道，随后小智看向超梦，此时超梦不见踪迹。
【小智，我在你身后。】超梦在光幕上说道。
看到消息，小智了然便跟上大木博士进入了樱木研究所。
研究所内
樱木博士正在介绍着精灵，突然，皮卡丘似乎若有所感，向着研究所外跑去，小智见状，同大木博士打过招呼便一起跟着出去了，与此同时光幕内：
【火焰鸟加入群聊】
【闪电鸟加入群聊】
【急冻鸟加入群聊】
【洛奇亚加入群聊】
小智只觉一阵恍惚，又有新的记忆出现，橘子群岛时所经历的冒险，下意识小智看向天空，洛奇亚的身影若隐若现。
“洛奇亚？”“皮卡。”似乎是听到了小智的话，洛奇亚一个俯身冲向小智，小智一愣，带着皮卡丘利落的爬上去，待小智坐稳后，洛奇亚再次跃向天空。
感受着耳边吹拂过的风，以及下方湛蓝的海面，小智有些惊讶，耳边似乎传来洛奇亚的声音：“抓紧了。”
下意识的小智和皮卡丘抓紧了洛奇亚，见到小智他们抓紧后洛奇亚直接冲进了海里，还贴心的给了个防护罩。
海底内见着各种各样的水系宝可梦，小智很是惊奇，略过一只又一只宝可梦，洛奇亚把握着分寸，带着小智重新回到海面降落到一座岛屿，岛屿上是各种草系宝可梦，将小智放到岛上后，洛奇亚便离开了。
光幕内
【凤王：洛奇亚，你就这么把小智扔到岛上不管了？还有你竟然偷偷摸摸的去找小智？】
【洛奇亚：找朋友叙叙旧，应该没问题吧，而且小智身边有那谁超梦，所以不用担心。】
【超梦：。】
对于光幕内发生的事，小智并未发觉，因为他此刻被岛上各类的宝可梦吸引了注意力。
逐渐的，太阳落下，小智才发觉自己此时不知道在哪，要怎么回去，索性盘腿坐下思考，这时他想起光幕，还未来得及看，便在超梦的帮助下回了枯叶市。
等回到枯叶市小智发现，大木博士和妈妈好像已经离开了，而他则备留下来，据说是帮助樱木博士研究。
对此，小智沉思，帮助樱木博士做研究应该很简单吧…